今回はpyvcfのインストール方法について解説していきます。
こちらはvcfファイルの情報をpython上で読み込むことができるライブラリになります。
こちらをpip install pyVCFでインストールしたところvcf.Readerがimportされないエラーが出ました1)。
ImportError : cannot import name 'Reader' from 'parser'
こちらをconda install pyVCFに変えてインストールし直したところ、エラーが消えて無事読み込むことができました。
理由はわかりませんが、pipを使わない方がよさそうです。
それでは今回はここまで。
【参考文献】
1) https://www.biostars.org/p/9507297/#9507298
こちらはvcfファイルの情報をpython上で読み込むことができるライブラリになります。
こちらをpip install pyVCFでインストールしたところvcf.Readerがimportされないエラーが出ました1)。
ImportError : cannot import name 'Reader' from 'parser'
こちらをconda install pyVCFに変えてインストールし直したところ、エラーが消えて無事読み込むことができました。
理由はわかりませんが、pipを使わない方がよさそうです。
それでは今回はここまで。
【参考文献】
1) https://www.biostars.org/p/9507297/#9507298
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