今回はpyvcfのインストール方法について解説していきます。

こちらはvcfファイルの情報をpython上で読み込むことができるライブラリになります。

こちらをpip install pyVCFでインストールしたところvcf.Readerがimportされないエラーが出ました1)

ImportError : cannot import name 'Reader' from 'parser'

こちらをconda install pyVCFに変えてインストールし直したところ、エラーが消えて無事読み込むことができました。

スクリーンショット 2022-06-26 17.22.05

理由はわかりませんが、pipを使わない方がよさそうです。

それでは今回はここまで。 

【参考文献】
1) https://www.biostars.org/p/9507297/#9507298